53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0057 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_R0057  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.858787  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0012  tRNA-Val  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000513005  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0054  tRNA-Val  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00910713  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-2  tRNA-Val  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000334583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0036  tRNA-Val  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_966  tRNA-Val  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00216309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0025  tRNA-Val  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.19601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0001  tRNA-Val  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0026  tRNA-Val  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0044  tRNA-Val  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.64476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0033  tRNA-Val  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435872  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0015  tRNA-Val  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000205698  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0048  tRNA-Val  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0017  tRNA-Val  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0049  tRNA-Val  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  87.3 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0068  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.392082  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0015  tRNA-Val  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0052  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.587124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0052  tRNA-Val  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00919857  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0087  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000568391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0084  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0064  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451693  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0025  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148774  normal  0.456967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0024  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143684  normal  0.454789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0040  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.710582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0039  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.722493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0010  tRNA-Val  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0025  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000204712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0002  tRNA-Ile  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000719363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0017  tRNA-Val  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000274688  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0001  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4309  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>