95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0044 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0044  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.64476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0064  tRNA-Val  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0033  tRNA-Val  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0012  tRNA-Val  94.44 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000513005  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0002  tRNA-Val  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884588  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0611  tRNA-Val  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0857734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0028  tRNA-Val  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.163089  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0046  tRNA-Val  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0019  tRNA-Val  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0025  tRNA-Val  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.19601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0045  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.374674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4574  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0200099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0043  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0073  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0044  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.306747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0048  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0187429  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0039  tRNA-Val  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.910644  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt01  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0037  tRNA-Val  90.38 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0054  tRNA-Val  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00910713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0022  tRNA-Val  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0746641  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0001  tRNA-Val  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA13  tRNA-Val  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00601929  normal  0.184013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0057  tRNA-Val  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.858787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  91.11 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0015  tRNA-Val  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0068  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000545577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0067  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000631396  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4309  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0062  tRNA-Val  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0001  tRNA-Val  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000456569  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0001  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0068  tRNA-Val  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.392082  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0046  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0026  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0013  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0059  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.40098  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0010  tRNA-Val  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0013  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688167  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0074  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0744587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0002  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0008  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0089  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0099  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0019  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0039  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1227  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.411176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2632  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.602317  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120577  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0073  tRNA-Val  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2629  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.8453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2150  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  88.1 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2626  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.888803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0051  tRNA-Val  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  88.1 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0019  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2949  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2440  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2943  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0074  tRNA-Val  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.593802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0010  tRNA-Val  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2946  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0066  tRNA-Val  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.603715  normal  0.0472692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0041  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>