More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_rna098 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03597  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03607  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03605  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000544354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03600  tRNA-Asn  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000077985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2866  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000326187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0031  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0031  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0028  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546995  normal  0.0230083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0008  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0029  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25599  normal  0.694984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0072  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0023  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0074  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0073  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0020  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0031  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0031  tRNA-Asn  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000643005  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0421  tRNA-Asn  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.747213  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsn02  tRNA-Asn  88.16 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0046  tRNA-Asn  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000652879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14010  tRNA-Lys  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.5197900000000005e-29  hitchhiker  0.00000218177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0118  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000046805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0075  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000559002  normal  0.199391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0123  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114106  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0121  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0069  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0071  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0401239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0054  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000490544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0119  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0122  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124513  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0069  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000102362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0071  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000229648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0072  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000849142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0074  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0053  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0070  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0072  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t09  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t08  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t07  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0076  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000596623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0077  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0079  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000505976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0080  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000390034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0074  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000584221  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0053  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000495579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0052  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000553909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0045  tRNA-Asn  93.1 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000133581  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0051  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000466422  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t10  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0124  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0120  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0068  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0474424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0073  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0422626  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00034  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00035  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0182063  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0039  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000583297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0040  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000809411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0042  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0486048  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04000  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000234259  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4675  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.10432e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4676  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2991999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4674  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.04285e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000000733307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0036  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0058  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0204591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0039  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000683779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0067  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2933  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000103893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2934  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000107091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0041  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0042  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0053  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00100848  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5043  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000344379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2877  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000083016  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0041  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.0000000000000766368  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0017  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000497879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0018  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000000318687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0062  tRNA-Asn  97.78 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000647678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0063  tRNA-Asn  97.78 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000418863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0055  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0679012 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1827  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1828  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2876  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00000608308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0056  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2816  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000213443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4673  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.54292e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0039  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.480095  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0040  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345644  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0029  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0902412  normal  0.0228096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0054  tRNA-Asn  89.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020745  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2504  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000220613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>