More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03607 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03607  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03597  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03605  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03600  tRNA-Asn  98.65 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2866  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000326187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000077985  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000544354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0031  tRNA-Asn  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0031  tRNA-Asn  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsn02  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0028  tRNA-Asn  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546995  normal  0.0230083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0080  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000113933  normal  0.120667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0076  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000573858  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0078  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000554135  normal  0.120054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0077  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000573858  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0081  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000113933  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0079  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000264288  normal  0.119023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0078  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000616028  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0024  tRNA-Asn  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0073  tRNA-Asn  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000291565  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0023  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0073  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0072  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0031  tRNA-Asn  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000643005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0008  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0029  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25599  normal  0.694984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0046  tRNA-Asn  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000652879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0074  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0062  tRNA-Asn  97.78 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000647678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0063  tRNA-Asn  97.78 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000418863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0045  tRNA-Asn  97.78 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000133581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0020  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0031  tRNA-Asn  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14010  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.5197900000000005e-29  hitchhiker  0.00000218177 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t07  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0053  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000495579  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t09  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0055  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000533833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0069  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0448406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0054  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000490544  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t10  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t08  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0051  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000473261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0052  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000553909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0051  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000466422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t048  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t049  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0054  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000507687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0068  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0474424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0118  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000046805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0122  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0061  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000104416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0065  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000102168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0064  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000482933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0052  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000046845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0068  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000331868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0069  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000102362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0070  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000211799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0071  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000229648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0072  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000849142  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0421  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.747213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0119  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0124  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0123  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0062  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000100655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0063  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0098  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000305665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0099  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000305665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0100  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0101  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0102  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0088  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000246842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0089  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000235445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0095  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000680778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0096  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000783428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0097  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000767746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0098  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000647145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0099  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0073  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000150296  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0074  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414669  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0075  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399431  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0076  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000334137  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0077  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0047  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479856  normal  0.63722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0048  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0049  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.666985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0050  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0053  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0072  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0070  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0074  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0073  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0422626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0121  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0120  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>