More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_R0048 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_R0048  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0047  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.479856  normal  0.63722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0050  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0049  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.666985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0027  tRNA-Asn  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000466235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0041  tRNA-Asn  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000273116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0028  tRNA-Asn  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0043  tRNA-Asn  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00393457  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3121t  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000518835  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1107t  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.122135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3192t  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000077985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2866  tRNA-Asn  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000326187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3118t  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000513556  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3164t  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000133455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0035  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0989882  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0048  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.780393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000544354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03605  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03597  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0007  tRNA-Asn  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03607  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03600  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0039  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000227587  normal  0.0269838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0051  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.022056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0031  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000781489  hitchhiker  0.000000692381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0030  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000864029  hitchhiker  0.00000418087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  93.18 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsn02  tRNA-Asn  85.53 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0039  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0153762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0038  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0043  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0523959 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0037  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00809358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0036  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0360191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0035  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  94.87 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0048  tRNA-Lys  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07689  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.754049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0036  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0023  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0320395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0043  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0018  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04002  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000208325  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0020  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0034  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2266  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0028  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000473663  hitchhiker  0.000687264 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0140  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0025  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0012  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0061328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0013  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0641793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2342  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0083  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456541  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0120  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0040  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0013  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00193967  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0017  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143613  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0148  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0017  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0018  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000139962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0033  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0050  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00633493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0076  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  normal  0.566101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0051  tRNA-Phe  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00174909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0002  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.099087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2817  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0040  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0071  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0421157  hitchhiker  0.003467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0076  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000822229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0014  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0010  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00296143  hitchhiker  0.00854354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0010  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0076  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41661  normal  0.163514 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0073  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>