174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_R0092 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_R0092  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0448761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0057  tRNA-Val  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00234927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0058  tRNA-Val  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00230233  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0059  tRNA-Val  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00221278  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3161t  tRNA-Val  87.88 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1713  tRNA-Val  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.205594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0088  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000319875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0089  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000342234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0090  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0091  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000288629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0092  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000281148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0093  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278646  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tVal03  tRNA-Val  89.66 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0106  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000011333  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0098  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0099  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0100  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000389381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0101  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000312411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0102  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000271468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0107  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000125343  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0105  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000937132  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0084  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000842373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0085  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000375389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0086  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0087  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0088  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000718158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0089  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000619858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0104  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000459096  normal  0.0566469 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0079  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000283513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0080  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000267941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0081  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000114332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0082  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0083  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000495241  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0093  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000828011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0094  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000297438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0095  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000338058  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0096  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000340582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0097  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000319482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0098  tRNA-Val  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000887403  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2916  tRNA-Val  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0850846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t034  tRNA-Val  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t036  tRNA-Val  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000159787  normal  0.229445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t038  tRNA-Val  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000157336  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t037  tRNA-Val  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000163594  normal  0.236842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t035  tRNA-Val  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00018344  normal  0.230227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t033  tRNA-Val  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  normal  0.228577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3218  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.229381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3219  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232653  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3220  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0584974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3221  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0555277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3222  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.055188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3223  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0588431  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0023  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000500863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0025  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000443719  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0077  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.035914  normal  0.156814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0078  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0323517  normal  0.156199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0079  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.101536  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0080  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273364  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0081  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.277615  normal  0.0524601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0082  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.278662  normal  0.0519347 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0083  tRNA-Val  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.380534  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t075  tRNA-Val  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t077  tRNA-Val  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0061  tRNA-Val  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0037  tRNA-Val  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000442416  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0061  tRNA-Val  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000062426  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0059  tRNA-Val  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000138631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0016  tRNA-Val  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna124  tRNA-Val  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0052  tRNA-Val  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00919857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0013  tRNA-Val  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0054  tRNA-Val  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0077  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00426255  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4228  tRNA-Val  86.44 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102748  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t074  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t076  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0056  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805133  normal  0.0381959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0057  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000143405  normal  0.0390481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0058  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000142133  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0059  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000125159  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0055  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0056  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0057  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0058  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000107196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0598  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0602  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.375399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0008  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138827  hitchhiker  0.000689808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0016  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113655  normal  0.435414 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0026  tRNA-Val  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000755245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0092  tRNA-Val  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000905029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>