269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0001 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000456569  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0025  tRNA-Val  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.19601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tVal03  tRNA-Val  92.86 
 
 		 80 bp  79.8  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0049  tRNA-Val  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000683912  normal  0.27317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0012  tRNA-Val  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000513005  hitchhiker  0.00749206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0003  tRNA-Val  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0048  tRNA-Val  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0049  tRNA-Val  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0054  tRNA-Val  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00910713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1201  tRNA-Val  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0742483  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0001  tRNA-Val  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00027  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.825713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0048  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000092114  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0042  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0046  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t55  tRNA-Val  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t56  tRNA-Val  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0053  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5035  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000158599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1534  tRNA-Val  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0495924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2378  tRNA-Val  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000316536  hitchhiker  0.00924941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2148  tRNA-Val  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000010936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0053  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.855863  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1557  tRNA-Val  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.939336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60190  tRNA-Val  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0032  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0054  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322484  hitchhiker  0.000000167745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1532  tRNA-Val  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000254029  hitchhiker  0.00110314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0045  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.653402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0054  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0691597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0067  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000631396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0068  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000545577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4667  tRNA-Val  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0015  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0053  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0699636  normal  0.799268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0071  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0046  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0070  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0045  tRNA-Val  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1750  tRNA-Val  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307379  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1520  tRNA-Val  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00188804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1919  tRNA-Val  95.35 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0105703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00028  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.813226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0047  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2379  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000292558  hitchhiker  0.00911124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1202  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0491839  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0076  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00448767  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0062  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000022739  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0061  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000225678  hitchhiker  0.00000327406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t34  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0987104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t35  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0521138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA41  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA42  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191671  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0068  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.392082  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0045  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.431879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0017  tRNA-Val  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1888  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1133  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646427  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2749  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0012  tRNA-Val  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000181787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2149  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1734  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0031  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00270422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1556  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0045  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4230  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000689927  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0339  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0351781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2596  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0075  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00433017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0077  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00426255  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1920  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0104306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0006  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0053  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452595  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1710  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5036  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0069  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229538  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4228  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0063  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000215806  hitchhiker  0.00000333382 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0041  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0001  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0076  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.083212  hitchhiker  0.00562166 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0961  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0032972  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2904  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0004  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0580435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1533  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.102488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28190  tRNA-Val  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.018303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0004  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105423  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0039  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00187665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2581  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0567199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2580  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0938444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0203  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00945827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1519  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000581354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1531  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000929457  hitchhiker  0.00112826 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1541  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.713195  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1751  tRNA-Val  95.24 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000295955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0070  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000820033  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0004  tRNA-Val  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0212233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>