More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_R0012 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0006  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0022  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0029  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0077  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0084  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0547  tRNA-Ile  98.61 
 
 
77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0008  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0062  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.648574  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0030  tRNA-Ile  97.26 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0014    96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA17  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0042  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0054  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0019  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848767  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0064  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17499  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0011  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0069  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0048  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0055  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0040  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.443427  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0014  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0032  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0052  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.461525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0006  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0058  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.102192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA9  tRNA-Ile  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  97.14 
 
 
77 bp  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  97.14 
 
 
77 bp  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  97.14 
 
 
77 bp  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  97.14 
 
 
77 bp  123  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  95.83 
 
 
77 bp  119  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0259  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1085  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0223  tRNA-Ile  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0090777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  94.37 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  94.37 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  94.37 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0022  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0041  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0012  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181038  normal  0.23369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0028  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  hitchhiker  0.002006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0012  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.430923 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0071  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.741425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0060  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0050  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0020  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0033  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.715295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0028  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0035  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt14  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.033496  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0080  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0027  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0014  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0021  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383429  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0035  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0041  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.018808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0067  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0634109  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0022  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.983676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0052  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.307306  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0071  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.207153  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0028  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0014  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.712374 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1021  tRNA-Ile  92.21 
 
 
79 bp  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1793  tRNA-Ile  92.21 
 
 
79 bp  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00299619  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1585  tRNA-Ile  92.21 
 
 
79 bp  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0020  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0043  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.333285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0053  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0036  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0042  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0043  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0007  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0022  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0019  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0011  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0055  tRNA-Ile  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744049  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6014  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6007  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.358731 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4348  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.265257  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4353  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0050  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303318 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0085  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0058  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0064  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0072  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.152177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0003  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00132267  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0042  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0003  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.784686  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0051  tRNA-Ile  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>