146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0019 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0010  tRNA-Arg  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0833672 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0037  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0012  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309103  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0620243  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309279  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309176  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309368  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0022  tRNA-Arg  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0040  tRNA-Arg  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309135  tRNA-Arg  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309215  tRNA-Arg  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.266005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0022  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0001  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263223  normal  0.0193915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0059  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0053  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0040  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0026  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0085  tRNA-His  92.59 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317086  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt15  tRNA-Arg  91.11 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0033    88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.465257  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4320  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.438611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0030  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54758  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0036  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.219616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0026  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0422227  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0056  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0044  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709803  normal  0.0256075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0003  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA24  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0036  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0020  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801009 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  88.14 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0012  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.670239 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0037  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261059  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1417  tRNA-His  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0045  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  88.14 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00117786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0026  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_830  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0047  tRNA-His  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0048  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.480879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0053  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0008  tRNA-Arg  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56031  normal  0.0314068 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0029  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.320042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0030  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.324137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0007  tRNA-Arg  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.129572 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1813  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2559  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2561  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA32  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.377477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0019  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.737932  normal  0.0155784 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0057  tRNA-Arg  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.921424  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.929932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0006  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00487  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00489  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01261  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna018  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000119113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna131  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000799453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0012  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.802134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0003  tRNA-Arg  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna020  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000590074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0012  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  85 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0035  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2650599999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0009  tRNA-Arg  85 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3099t  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000107843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3101t  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000115103  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3155t  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0552  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.775788  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0553  replicative DNA helicase  100 
 
 		 1485 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.78949  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  84.75 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.452504  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0033  tRNA-Arg  88.37 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.456547  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  84.13 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0022  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0027696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000399427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261582 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>