43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0001 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263223  normal  0.0193915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0022  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0053  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0010  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0833672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0026  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0040  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309368  tRNA-Arg  92.16 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309176  tRNA-Arg  92.16 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309279  tRNA-Arg  92.16 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309103  tRNA-Arg  92.16 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0620243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0012  tRNA-Arg  92.16 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0037  tRNA-Arg  92.16 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309135  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309215  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.266005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0040  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0022  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0018  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000528633  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0048  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0003  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.844027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0006  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0011  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000030299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0057  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0022  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0027696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0421069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.218598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0093  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0035  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0734164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0002  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0062  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0057  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0014  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0177881  hitchhiker  0.00685945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0053  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0040  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0475845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>