38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_R0011 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.844027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0006  tRNA-Arg  98.72 
 
 		 78 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0001  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263223  normal  0.0193915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0059  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0022  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0053  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0062  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0079  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000030299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna53  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0002  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318513  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0002  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0013  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629989  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.824149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1317  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0566482  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0025  tRNA-Trp  100 
 
 		 175 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000000493252  hitchhiker  0.00000464585 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0421069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>