25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0062 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0062  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0032  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0383416  normal  0.814882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0015  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.147011  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0027  tRNA-Arg  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00271379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0034  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.245593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0057  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.844027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0006  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0034  tRNA-Arg  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0016  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0421069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0022  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000445739  unclonable  9.38504e-19 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0004  tRNA-Arg  82.67 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000030299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263223  normal  0.0193915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  MTHE_0  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0013  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>