183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0055 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0079  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna53  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0010  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0004  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 94 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0045  tRNA-Arg  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0003  tRNA-Arg  97.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0043  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0035  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna022  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000131099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0067  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0015  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  92.68 
 
 		 101 bp  58  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0026  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0045  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0029  tRNA-Arg  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00115694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318513  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00485  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1317  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0566482  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0023  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0034  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.1136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0005  tRNA-Arg  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000297571  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0033  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3097t  tRNA-Arg  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  84.51 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0033  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0007  tRNA-Trp  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000145435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0030  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000202832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27060  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.14879  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0085  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000064682  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  88 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt025  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000274648  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0008  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56031  normal  0.0314068 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0740  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0004  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0200827  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0024  tRNA-Arg  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0007  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.129572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0009  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0016  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.228908 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0044  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00954192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  90.24 
 
 		 98 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0035  tRNA-Arg  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0064  tRNA-Arg  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0022  tRNA-Arg  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.189189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0020  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2557  tRNA-Arg  83.56 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.55794e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0041  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0047  tRNA-Arg  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.67913  normal  0.0842935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>