101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_R0025 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 78 bp  131  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  92.41 
 
 		 79 bp  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 94 bp  97.6  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  96.49 
 
 		 94 bp  97.6  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0013  tRNA-OTHER  97.87 
 
 		 101 bp  85.7  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 94 bp  81.8  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  77.8  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  73.8  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_0  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 94 bp  73.8  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 94 bp  73.8  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0001  tRNA-OTHER  95.56 
 
 		 98 bp  73.8  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0811775 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 		 101 bp  73.8  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0028  tRNA-OTHER  95.45 
 
 		 95 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000246213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  97.44 
 
 		 98 bp  69.9  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 99 bp  69.9  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  100 
 
 		 119 bp  67.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  90.32 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  97.22 
 
 		 98 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0067  tRNA-Arg  86.84 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  94.87 
 
 		 98 bp  61.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  87.88 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  87.88 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  87.88 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  85.53 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0045  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.732814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 93 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0039  tRNA-Ile  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0021  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 104 bp  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0060  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01505  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.946328  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01580  tRNA-Cys  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01590  tRNA-Cys  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  85.29 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  85.29 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  84.21 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0079  tRNA-Arg  84.21 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19370  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0058  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0023  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0079  tRNA-OTHER  100 
 
 		 121 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0038  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0030  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0014  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.951342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  83.33 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  84.29 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0015  tRNA-Arg  84.29 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00129328  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0052  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179946  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0020  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2557  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.55794e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0082  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  84.29 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00485  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000315288  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  84.29 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3097t  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0050  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000306813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  84.29 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0048  tRNA-Arg  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna022  tRNA-Arg  85.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000131099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09780  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0646814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>