60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_R0020 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_R0041  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0008  tRNA-Arg  98.72 
 
 		 78 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0045  tRNA-Arg  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.824149  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0015  tRNA-Arg  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0036  tRNA-Arg  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0930227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2531  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138552  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2520  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00150959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2523  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2308  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00164711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000178277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2227  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000134564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2224  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000681563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2622  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0040  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0051  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0034  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299722  normal  0.0234425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna53  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0030  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0079  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1317  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0566482  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0039    93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0135973  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0007  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0315655 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0019  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0015  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0040  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0004  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0921241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0029  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>