299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A1317 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1317  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0566482  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0020  tRNA-Arg  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.845791  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1005  tRNA-Arg  89.33 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt19  tRNA-Arg  89.33 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt18  tRNA-Arg  89.33 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0903  tRNA-Arg  89.33 
 
 
79 bp  85.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0029  tRNA-Arg  89.33 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  89.33 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0050  tRNA-Arg  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0039275  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0039  tRNA-Arg  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0048  tRNA-Arg  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0071188  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna11  tRNA-Arg  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0049  tRNA-Arg  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00771179  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0004  tRNA-Arg  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0043  tRNA-Arg  88 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000141342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0031  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.663403  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0031  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna10  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0051  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.524822  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0050  tRNA-Arg  88.16 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0050  tRNA-Arg  88.16 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.557723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0001  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.696589  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0027  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0004  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000109106  hitchhiker  0.000000979615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0045  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000739134 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  87.67 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0202  tRNA-Arg  87.69 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0053  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531886  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000747728  normal  0.0921402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60470  tRNA-Arg  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302524  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000223271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60460  tRNA-Arg  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204002  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399679  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000965131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000104257  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318513  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0113  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000284792  normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0047  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000357369  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0079  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000331563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  86.11 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0010  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000576852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0044  tRNA-Arg  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0235767  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0012  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000569995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0037  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0011  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00060097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0001  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0021  tRNA-Arg  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0204711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0025  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0006  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000140525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0024  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0114  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00529639  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0115  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000730422  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0116  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000643012  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0052  tRNA-Arg  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.717648  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna53  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0055  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000119585  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0056  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000106381  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0034  tRNA-Arg  85.51 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.193658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0064  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00996897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0038  tRNA-Arg  85.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0047  tRNA-Arg  84.72 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000053333  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  84.72 
 
 
77 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0102  tRNA-Arg  84.72 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831784  decreased coverage  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0143  tRNA-Arg  84.72 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000714151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0088  tRNA-Arg  84.72 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315213  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0053  tRNA-Arg  85.29 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0021  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.81714e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0025  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000117209  hitchhiker  0.00392974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0035  tRNA-Arg  84 
 
 
77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000279493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0037  tRNA-Arg  84 
 
 
77 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454373  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0015  tRNA-Arg  84 
 
 
77 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.006627  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0027  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000577266  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0026  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000629117  hitchhiker  0.00379847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>