281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0057 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0029  tRNA-Arg  91.94 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.403719 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0041  tRNA-Arg  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0022  tRNA-Arg  90.32 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00550976  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0024  tRNA-Arg  90.32 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0049  tRNA-Arg  90.32 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  90.32 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2794  tRNA-Arg  95.24 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0021  tRNA-Arg  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.489181  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0044  tRNA-Arg  88.71 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.959306  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0028  tRNA-Arg  92.45 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000461136  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  92.45 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1167  tRNA-Arg  94.87 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.394373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  88.89 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0124116  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0029  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.179908  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2297  tRNA-Arg  94.87 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00877192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  88.89 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1603  tRNA-Arg  94.87 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1999  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1396  tRNA-Arg  94.87 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00150551  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309097  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2498  tRNA-Arg  94.87 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2907  tRNA-Arg  94.87 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000134829  hitchhiker  0.0000000000437097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1769  tRNA-Arg  94.87 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000113481  normal  0.0122655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0024  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90.74 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309379  tRNA-Arg  89.66 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0734599  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0035  tRNA-Arg  87.1 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0032  tRNA-Arg  87.1 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133841  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0036  tRNA-Arg  87.1 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398617  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0035  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0064  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0032  tRNA-Arg  87.1 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51737  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2262  tRNA-Arg  94.74 
 
 
79 bp  60  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54251  hitchhiker  0.00000000419015 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  90.74 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  90.74 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0047  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.67913  normal  0.0842935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24820  tRNA-Arg  88.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.173239 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0023  tRNA-Arg  90.57 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601001  normal  0.725234 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  90.57 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6039  tRNA-Arg  90.57 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  88.52 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0057  tRNA-Arg  88.33 
 
 
77 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3216  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.415947  hitchhiker  0.00933438 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2192  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000430612  hitchhiker  0.000000134605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3534  tRNA-Arg  92.31 
 
 
79 bp  54  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00384418  hitchhiker  0.000000731088 
 
 
-
 
NC_002950  PGt34  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  54  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0029  tRNA-Arg  93.02 
 
 
74 bp  54  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  54  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11730  tRNA-Arg  87.3 
 
 
77 bp  54  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827241  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0764025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0026  hypothetical protein  86.21 
 
 
324 bp  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000553875  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  86.21 
 
 
73 bp  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000133182  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0816  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000928863  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0817  tRNA-Lys  86.21 
 
 
78 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000862266  normal  0.885127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4684  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.3682299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.396889999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0073  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623521  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  85.71 
 
 
75 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  94.12 
 
 
76 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000208772  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0593  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0667  tRNA-Lys  86.21 
 
 
78 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  86.21 
 
 
78 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4660  tRNA-Lys  86.21 
 
 
78 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0071  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577417  normal  0.268649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0036  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000584737  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  86.21 
 
 
78 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000107183  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000229653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0768  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000959618  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4239  tRNA-Lys  86.21 
 
 
78 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00412423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  86.21 
 
 
78 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175235  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0771  tRNA-Lys  86.21 
 
 
78 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162037  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0818  tRNA-Lys  86.21 
 
 
78 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0005423  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  86.21 
 
 
76 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00251  tRNA-Lys  86.21 
 
 
73 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00376  tRNA-Lys  86.21 
 
 
73 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00467  tRNA-Lys  86.21 
 
 
73 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>