100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_R0021 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.489181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0064  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0035  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0047  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.67913  normal  0.0842935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0024  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  97.83 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0067  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0022  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.189189 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  92.45 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0009  tRNA-Arg  86.84 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2192  tRNA-Arg  92.31 
 
 
79 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000430612  hitchhiker  0.000000134605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0028  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000461136  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1396  tRNA-Arg  95.24 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00150551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1603  tRNA-Arg  95.24 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2297  tRNA-Arg  95.24 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00877192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2498  tRNA-Arg  95.24 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1769  tRNA-Arg  95.24 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000113481  normal  0.0122655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1167  tRNA-Arg  95.24 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.394373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2794  tRNA-Arg  95.24 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3216  tRNA-Arg  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.415947  hitchhiker  0.00933438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0057  tRNA-Arg  95.24 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0028  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00528012  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6039  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0013  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0934099  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  87.3 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2262  tRNA-Arg  92.86 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54251  hitchhiker  0.00000000419015 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2907  tRNA-Arg  92.86 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000134829  hitchhiker  0.0000000000437097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3534  tRNA-Arg  92.86 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00384418  hitchhiker  0.000000731088 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt34  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0028  tRNA-Val  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252739  normal 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  87.5 
 
 
80 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000168657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0091  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000502507  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  88.46 
 
 
74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0116  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000040989  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0029  tRNA-Arg  88.46 
 
 
74 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0023  tRNA-Arg  88.46 
 
 
74 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601001  normal  0.725234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  84.51 
 
 
77 bp  54  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0109  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0031  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0044  tRNA-Arg  87.93 
 
 
73 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.959306  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0037  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000145223 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0018  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0239908  hitchhiker  0.00100418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0053  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0021  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  84.93 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0050  tRNA-Arg  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  85.71 
 
 
80 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152182  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  86.54 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000137515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5793  tRNA-Arg  85.71 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0490  tRNA-Arg  86.54 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0057  tRNA-Arg  87.5 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0101  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0064  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0638  tRNA-Arg  85.71 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375137  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0120  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000162485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4566  tRNA-Arg  85.71 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309129  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.751283  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309097  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309209  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  86.44 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0024  tRNA-Arg  86.44 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0029  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.179908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0034  tRNA-Arg  86.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.193658  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  83.1 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0020  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0247478  normal  0.430055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0041  tRNA-Arg  86.44 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309379  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0734599  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  82.86 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0167609  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_654  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.026244  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1748  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0337298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0023  tRNA-Arg  88.1 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.2030600000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0032  tRNA-Arg  89.13 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0147918 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0024  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1514  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0088  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.56142e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1545  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0924  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0049  tRNA-Arg  86.21 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1714  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0051  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0056  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.239639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0016  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0047026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2749  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  85.19 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0033  tRNA-Arg  89.13 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.88902  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>