88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2907 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2907  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000134829  hitchhiker  0.0000000000437097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1603  tRNA-Arg  98.73 
 
 
79 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2498  tRNA-Arg  98.73 
 
 
79 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1167  tRNA-Arg  98.73 
 
 
79 bp  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.394373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2262  tRNA-Arg  97.47 
 
 
79 bp  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.54251  hitchhiker  0.00000000419015 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1769  tRNA-Arg  97.47 
 
 
79 bp  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000113481  normal  0.0122655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3534  tRNA-Arg  97.44 
 
 
79 bp  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00384418  hitchhiker  0.000000731088 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3216  tRNA-Arg  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.415947  hitchhiker  0.00933438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1396  tRNA-Arg  96.2 
 
 
79 bp  133  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00150551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2297  tRNA-Arg  96.2 
 
 
79 bp  133  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00877192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2794  tRNA-Arg  94.94 
 
 
79 bp  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2192  tRNA-Arg  94.94 
 
 
79 bp  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000430612  hitchhiker  0.000000134605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309268  tRNA-Arg  91.53 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.292305 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0020  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0247478  normal  0.430055 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309129  tRNA-Arg  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.751283  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0023  tRNA-Arg  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.601001  normal  0.725234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0057  tRNA-Arg  94.87 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309209  tRNA-Arg  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0052  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165142  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0012  tRNA-Arg  88.14 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0409907  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309379  tRNA-Arg  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0734599  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0021  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.489181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6039  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0064  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3149  tRNA-Met  96.88 
 
 
75 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000320663  hitchhiker  0.0000000000372776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1850  tRNA-Met  96.88 
 
 
75 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00244712  hitchhiker  0.00000000792688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt34  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0039  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.722493  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0087  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000568391  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0084  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347447  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0025  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148774  normal  0.456967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0024  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143684  normal  0.454789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0040  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.710582  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0029  tRNA-Arg  90.7 
 
 
74 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0024  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0047  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.67913  normal  0.0842935 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  86.21 
 
 
80 bp  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0035  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0064  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0029  tRNA-Arg  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.179908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309097  tRNA-Arg  85.96 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0124116  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0057  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0044  tRNA-Arg  88.46 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.959306  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1999  tRNA-Arg  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0067  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0052  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280732  normal  0.142339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0050  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000104692  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.23 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.23 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.23 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0325  tRNA-Arg  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.924352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0415  tRNA-Lys  87.23 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0379576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0174  tRNA-Lys  87.23 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0025  tRNA-Lys  87.23 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0132598  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  89.47 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.18 
 
 
80 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000168657  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309132  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0060  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.206205  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0061  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.304237  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0062  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.296107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>