175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0002 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0052  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0011  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0029  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.403719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0031  tRNA-Arg  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.464558  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0057  tRNA-Arg  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0035  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0032  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0036  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0024  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0032  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0019  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414165 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0021  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0049  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0124116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0022  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00550976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0033  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.296295 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1999  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000331563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000223271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000747728  normal  0.0921402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000965131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0041  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6039  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0031  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60210  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0004  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0102  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831784  decreased coverage  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0041  tRNA-Arg  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0106412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0047  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000053333  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0143  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000714151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00484  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0490424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0065  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0119  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.495298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0013  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.825441  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3262  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0060  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.863552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0005  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0066  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0068  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0005  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0005  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0056  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0005  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3301  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.979254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1533  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3916  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000194682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3988  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3069  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0075  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0002  tRNA-Arg  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.469319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0085  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399679  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000104257  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0490  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0113  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000284792  normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0047  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000357369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0001  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.285544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0056  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0065  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0058  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.340534  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_002620  TC0026  hypothetical protein  88.24 
 
 		 324 bp  54  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000553875  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000133182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t50  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294768  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R55  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41340  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.383585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0040  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0039  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247045  normal  0.262143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0059  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3506  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0063  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0052  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280732  normal  0.142339 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0062  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0088  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0007  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.173702  normal  0.696884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t45  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA31  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.977486  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0014  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000764457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3277  tRNA-Ser  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0069  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139316  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14031  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000460426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.02275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>