28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3277 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3277  tRNA-Ser  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0069  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139316  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0060  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.863552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0075  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0107603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.469319 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3069  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3988  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3916  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000194682  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1533  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS00484  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0490424  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3301  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.979254  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0068  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0066  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3262  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0119  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.495298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0065  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0013  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  93.7  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.825441  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0085  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0065  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0019  tRNA-Arg  90.48 
 
 
76 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0040  tRNA-Val  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>