49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0062 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0062  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0009  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0475152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  98.04 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  98.04 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0024  tRNA-Thr  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0025  tRNA-Thr  87.67 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000411074  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0003  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0008  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0012  tRNA-Thr  88.57 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0004  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0003  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0009  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.317875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0003  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.203261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0088  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31670  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0061  tRNA-Thr  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000697471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0020  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0037  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928979  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0005  tRNA-Val  90.38 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0032  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0032  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571749  normal  0.068685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0052  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0021  tRNA-Thr  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0625627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0055  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.756499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0003  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.300151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0013  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0043  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.168441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0031  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0033  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.296295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0056  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0053  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0058  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.340534  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0011  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0033  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0046  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0468144  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0072  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.465958  hitchhiker  0.00803701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0052  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0005  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0057  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0062  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0006  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168855  normal  0.285381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA51  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0701295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  86 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000131783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>