26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_14031 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_14031  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000460426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0021  tRNA-Val  94.52 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0018  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0243467  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0039  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.02275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0017  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0017  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0043  tRNA-Val  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0298498  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0024  tRNA-Val  93.94 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0029  tRNA-Val  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0003  tRNA-Val  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0021  tRNA-Val  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.357184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0021  tRNA-Val  86.89 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0049  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.193583  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04040  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0005  tRNA-Val  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0005  tRNA-Val  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0007  tRNA-Val  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414165 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0047  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0440889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0029  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2270  hypothetical protein  100 
 
 		 333 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t24  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>