20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0024 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0024  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14031  tRNA-Val  93.94 
 
 
75 bp  99.6  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000460426  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0039  tRNA-Val  92.65 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.02275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0021  tRNA-Val  90.77 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0017  tRNA-Val  89.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0017  tRNA-Val  89.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217131  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0018  tRNA-Val  89.23 
 
 
75 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0243467  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0043  tRNA-Val  93.75 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0298498  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  87.27 
 
 
75 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0035  tRNA-Val  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.382537  normal  0.802971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2270  hypothetical protein  91.67 
 
 
333 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0056  tRNA-Val  86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0053    86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA28  tRNA-Val  86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0064  tRNA-Val  86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.022514  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0017  tRNA-Val  86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.757994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0060  tRNA-Val  86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00507823  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0048  tRNA-Val  86.54 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0268651  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0003  tRNA-Val  85.19 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0001  tRNA-Ile  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.227787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>