55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0043 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0042  tRNA-Val  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288324  hitchhiker  0.00194275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2615  tRNA-Val  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.71269  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0018  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0243467  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0043  tRNA-Val  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0298498  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0017  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0017  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0034  tRNA-Val  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0146998  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0029  tRNA-Val  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.76241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0049  tRNA-Val  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0020  tRNA-Val  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000127781  normal  0.601367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04040  tRNA-Val  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0045  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0021  tRNA-Val  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0021  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0144657  normal  0.36354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0028  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.464795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-1  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0049359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t24  tRNA-Val  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14031  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000460426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0035  tRNA-Val  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0014  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194107  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15450  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0490498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0042  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0007  tRNA-Val  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0065  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0059636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0005  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0040  tRNA-Val  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00410606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0040  tRNA-Val  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0007  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0005  tRNA-Val  91.89 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0051  tRNA-Val  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.223947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t15  tRNA-Val  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0048  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.546388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0050  tRNA-Val  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0006  tRNA-Ala  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0953  tRNA-Val  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0034  tRNA-Val  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0899378  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0027  tRNA-Val  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.480715 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0020  tRNA-Val  88.37 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0053  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000250607  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0038  tRNA-Val  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.463505  normal  0.275868 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000282186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000910848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0034  tRNA-Val  84.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0023  tRNA-Met  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0036  tRNA-Val  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>