93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0042 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0042  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0048  tRNA-Val  95.74 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.546388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0069  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  97.56 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0050  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651338  normal  0.744651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0050  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.568856  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0005  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0027  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.480715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0020  tRNA-Val  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0050  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0007  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0007  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0014  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194107  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0041  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0953  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0005  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t15  tRNA-Val  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0043  tRNA-Val  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172535  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0015  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0064  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0147303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0114  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0035  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0020  tRNA-Val  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320151  normal  0.0855025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0030  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70827  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0047  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0018  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00275689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0041  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0072  tRNA-Val  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  90.48 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0057  tRNA-Val  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.700226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0054  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.452754 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0040  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0024  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.508678  normal  0.235406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1555  tRNA-Val  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0018  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0033  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000112986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0046  tRNA-Val  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498396  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4309  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0031  tRNA-Val  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.03601e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0011  tRNA-Val  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560887  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11940  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000016484  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0052  tRNA-Val  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.599035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0072  tRNA-Val  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0078  tRNA-Val  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0043  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0039  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.867547  hitchhiker  0.000112761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0077  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0001  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0001  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.613575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0035  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.491254  normal  0.639036 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0001  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.709613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-2  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.516841  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0049  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.890961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0020  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0496105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>