18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_R0034 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_R0034  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0031  tRNA-Val  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14023  tRNA-Val  95.95 
 
 		 75 bp  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0027  tRNA-Val  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0027  tRNA-Val  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0030  tRNA-Val  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521992  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0047  tRNA-Val  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0033  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0332381  normal  0.0106585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0040  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0051  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.223947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0040  tRNA-Val  85.14 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00410606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  83.78 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2615  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.71269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0042  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288324  hitchhiker  0.00194275 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0028  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.464795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  84.48 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  82.43 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>