49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0023 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0023  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0035  tRNA-Met  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.906537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0019  tRNA-Met  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0053  tRNA-Met  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307129  normal  0.0211178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0036  tRNA-Met  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.784357  normal  0.0160013 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0064  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00167035  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0031  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.759834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0034  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0041  tRNA-Met  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0006  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0004  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0477942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0089  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014219  hitchhiker  0.00718403 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0044  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0004  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0004  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0045  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0455  tRNA-Met  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00135587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0012  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0023  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1193  tRNA-OTHER  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000739328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07670  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0022  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158353  normal  0.287055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0050  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0010  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0009  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0013  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0009  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0051  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0022  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030404 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14038  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.704377 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0018  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.721782  hitchhiker  0.000298186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0019  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0020  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0021  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>