19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_R0021 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_R0021  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0018  tRNA-Val  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0243467  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0017  tRNA-Val  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0017  tRNA-Val  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0043  tRNA-Val  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0298498  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14031  tRNA-Val  94.52 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000460426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0024  tRNA-Val  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0039  tRNA-Val  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.02275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0049  tRNA-Val  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.193583  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37110  tRNA-Phe  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0860664  normal  0.0427609 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0015  tRNA-Val  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1842  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0022  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04040  tRNA-Val  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0003  tRNA-Val  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0020  tRNA-Val  82.86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000127781  normal  0.601367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>