22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t1842 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t1842  tRNA-Asn  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0059  tRNA-Asn  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1107t  tRNA-Asn  91.84 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.122135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3192t  tRNA-Asn  91.84 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3164t  tRNA-Asn  91.84 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000133455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3121t  tRNA-Asn  91.84 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000518835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3118t  tRNA-Asn  91.84 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000513556  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0007  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000363973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0069  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000102362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0071  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000229648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0072  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000849142  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsn02  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0076  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000596623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0080  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000390034  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309272  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1693  tRNA-Asn  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.616458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0076  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000019522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0074  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000706993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0056  tRNA-Asn  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0070  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000211799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0068  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000331868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0021  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>