288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3121t on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3118t  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000513556  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1107t  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.122135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3164t  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000133455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3121t  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000518835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3192t  tRNA-Asn  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0007  tRNA-Asn  96.67 
 
 
76 bp  103  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000363973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsn02  tRNA-Asn  96.67 
 
 
79 bp  103  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0077  tRNA-Asn  96.49 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000573858  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0073  tRNA-Asn  96.49 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000291565  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0079  tRNA-Asn  96.49 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000264288  normal  0.119023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0076  tRNA-Asn  96.49 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000573858  normal  0.201215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0078  tRNA-Asn  96.49 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000616028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0081  tRNA-Asn  96.49 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000113933  normal  0.124015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0080  tRNA-Asn  96.49 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000113933  normal  0.120667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0078  tRNA-Asn  96.49 
 
 
76 bp  97.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000554135  normal  0.120054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0124  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t080  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000127089  normal  0.640571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0052  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000553909  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t082  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000111549  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t079  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000110415  normal  0.651496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0063  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0071  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0401239  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t048  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t049  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t050  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t051  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t052  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0051  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0050  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000774224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0052  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000813258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0120  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0122  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0055  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000533833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0051  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000473261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0053  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000303697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0054  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000490544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t078  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000116126  normal  0.643909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t081  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000129685  normal  0.647259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0070  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042051  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0051  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000466422  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0072  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0416194  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0065  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000102168  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0049  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0068  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000331868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0069  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000102362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0070  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000211799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0071  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000229648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0072  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000849142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0062  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000100655  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0074  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000706993  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0421  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.747213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0068  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0474424  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0098  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000305665  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0099  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000305665  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0100  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685939  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0101  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753744  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0102  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804325  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0088  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000246842  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0089  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000235445  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0090  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000121304  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0091  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000108564  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0092  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000095215  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0076  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000596623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0077  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0079  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000505976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0080  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000390034  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0077  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000220166  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0076  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000019522  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t10  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0123  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0064  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000482933  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0074  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000584221  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0095  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000680778  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0096  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000783428  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0097  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000767746  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0098  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000647145  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0099  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000653794  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0073  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000150296  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0074  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414669  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0075  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399431  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0076  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000334137  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0077  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0075  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000559002  normal  0.199391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0119  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0118  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000046805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0061  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000104416  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0052  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000046845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0121  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0073  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0422626  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0054  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000507687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0069  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0448406  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0053  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000495579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0053  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000454506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0074  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0206519  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t07  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t08  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t09  tRNA-Asn  94.74 
 
 
76 bp  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsn01  tRNA-Asn  93.33 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsn03  tRNA-Asn  93.33 
 
 
79 bp  87.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4674  tRNA-Asn  92.98 
 
 
78 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.04285e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>