282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0026 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  93.85 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0045  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0049  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0031  tRNA-Val  93.22 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0005  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0005  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0007  tRNA-Val  94.44 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0044  tRNA-Val  90.77 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-2  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.516841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  91.53 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0038  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0054  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0048  tRNA-Val  97.67 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.546388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0036  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.012717  normal  0.28653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t15  tRNA-Val  92.59 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0007  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0953  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0027  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.480715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0050  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  91.38 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0041  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0014  tRNA-Val  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0042  tRNA-Val  97.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0050  tRNA-Val  95.45 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651338  normal  0.744651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0050  tRNA-Val  95.45 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.568856  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0040  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0033  tRNA-Val  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000112986  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0043  tRNA-Val  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0020  tRNA-Val  90.74 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  87.69 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0043  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172535  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0013  tRNA-Val  92.54 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0058  tRNA-Val  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309382  tRNA-Val  86.15 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.658487  normal  0.0584078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309269  tRNA-Val  86.15 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0046  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467185  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14034  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0014  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  86.15 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0014  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0018  tRNA-Val  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0055  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0679296  normal  0.0243248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0052  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222044  normal  0.0244207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0032  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0054  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163017  normal  0.0248084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0053  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165796  normal  0.0236662 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0033  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0031  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0032  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0026  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0027  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767943 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0030  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t075  tRNA-Val  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0057  tRNA-Val  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000143405  normal  0.0390481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0058  tRNA-Val  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000142133  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0060  tRNA-Val  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140872  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0061  tRNA-Val  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  normal  0.0392257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0056  tRNA-Val  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000122931  normal  0.695646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>