67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t24 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_t24  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0029  tRNA-Val  93.42 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0035  tRNA-Val  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0034  tRNA-Val  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0899378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0028  tRNA-Val  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15450  tRNA-Val  96.15 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0490498  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04040  tRNA-Val  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0049  tRNA-Val  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000400511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0012  tRNA-Val  85.53 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt022  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000116471  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0743  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0043  tRNA-Val  90.91 
 
 
72 bp  56  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00202  tRNA-Ile  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0057  tRNA-Val  84.51 
 
 
77 bp  54  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.385214  hitchhiker  0.00196821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna039  tRNA-Ile  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00772194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna079  tRNA-Ile  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0722838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna157  tRNA-Ile  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00196  tRNA-Ile  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00329  tRNA-Ile  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03616  tRNA-Ile  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03720  tRNA-Ile  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0035  tRNA-Val  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00123613  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_006686  CND00270  tRNA-Val  96.55 
 
 
105 bp  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08020  tRNA-Val  96.55 
 
 
103 bp  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0001  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0021  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R18  tRNA-Met  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0048  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.758644  normal  0.700534 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0018  tRNA-Val  84.13 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0018  tRNA-Val  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2075  tRNA-Ile  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00411358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0064  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00167035  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0067  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.021091  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0005  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108014  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0015  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2707  tRNA-Ile  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2800  tRNA-Ile  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000121659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0005  tRNA-Ile  84.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0034  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0015  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.776869  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0033  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0033  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0036  tRNA-Ile  84.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0053  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0873696  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0007  tRNA-Val  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0036  tRNA-Val  91.18 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0050  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0005  tRNA-Val  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0005  tRNA-Val  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858584  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14031  tRNA-Val  89.47 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000460426  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0031  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.136071  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0181  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00212444  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0037  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0486  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.212105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0007  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309042  normal  0.118966 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0004  tRNA-Val  83.33 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>