175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_R0035 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133841  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398617  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51737  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0029  tRNA-Arg  95.89 
 
 
73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.403719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0024  tRNA-Arg  93.85 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0044  tRNA-Arg  91.3 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.959306  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t50  tRNA-Arg  92.42 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294768  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t45  tRNA-Arg  92.42 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA31  tRNA-Arg  92.42 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.977486  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R55  tRNA-Arg  92.42 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  92.42 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0040  tRNA-Arg  92.42 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.138426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41340  tRNA-Arg  92.42 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.383585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0041  tRNA-Arg  92.42 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0106412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0063  tRNA-Arg  92.42 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60210  tRNA-Arg  92.42 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0039  tRNA-Arg  92.42 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247045  normal  0.262143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0059  tRNA-Arg  92.42 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3506  tRNA-Arg  92.42 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0049  tRNA-Arg  91.94 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0050  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581658  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0045  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0043  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478862  hitchhiker  0.000308471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0043  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315798 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0017  tRNA-Arg  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0023  tRNA-Arg  92.19 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_002620  TC0026  hypothetical protein  94.12 
 
 
324 bp  77.8  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000553875  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  94.12 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000133182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0027  tRNA-Arg  91.04 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0953414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0016  tRNA-Arg  89.55 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0013  tRNA-Arg  91.04 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0011  tRNA-Arg  90.32 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0004  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399679  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000104257  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0113  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000284792  normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0047  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000357369  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000331563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000223271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000747728  normal  0.0921402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000965131  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  92.59 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0041  tRNA-Arg  89.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0002  tRNA-Arg  89.23 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000177149  normal  0.0400034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0026  tRNA-Arg  89.71 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0131801 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0018  tRNA-Arg  89.55 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  89.39 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  89.39 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0025  tRNA-Arg  88.57 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0088  tRNA-Arg  89.39 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315213  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0102  tRNA-Arg  89.39 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831784  decreased coverage  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0047  tRNA-Arg  89.39 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000053333  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0143  tRNA-Arg  89.39 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000714151  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0030  tRNA-Arg  88.41 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.474637  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0057  tRNA-Arg  92.31 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0049  tRNA-Arg  90.38 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  86.57 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  87.88 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0029  tRNA-Arg  87.88 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.763657  normal  0.753454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0057  tRNA-Arg  87.1 
 
 
73 bp  60  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0013  tRNA-Arg  91.3 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.195236 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  87.88 
 
 
77 bp  60  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0017  tRNA-Arg  86.49 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  86.15 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0029  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0022  tRNA-Arg  86.15 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00550976  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  86.15 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11730  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827241  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  85.51 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24820  tRNA-Arg  84.72 
 
 
76 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.173239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0027  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0275955  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0026  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.423722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0012  tRNA-Thr  88.46 
 
 
74 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  86.76 
 
 
77 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0034  tRNA-Arg  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.09 
 
 
74 bp  54  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  89.09 
 
 
77 bp  54  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  86.57 
 
 
77 bp  54  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0036  tRNA-Val  87.1 
 
 
72 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.552883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0033  tRNA-Arg  87.1 
 
 
77 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.974847  normal  0.895856 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0017  tRNA-Arg  87.04 
 
 
77 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.915469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0043  tRNA-Arg  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  88.68 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  94.59 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497461 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>