More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0713 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  143  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0018  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 77 bp  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000331563  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000223271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000747728  normal  0.0921402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399679  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000104257  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0047  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000357369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000965131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0113  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000284792  normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0088  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  95.52 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0143  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000714151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0102  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831784  decreased coverage  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0047  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000053333  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0010  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  95.38 
 
 		 76 bp  97.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t50  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294768  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t45  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0039  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247045  normal  0.262143 
 
 
-
 
NC_006368  lppt24  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt24  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA31  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.977486  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0041  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0106412  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R55  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0787  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.506305  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0004  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0063  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60210  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0059  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3506  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0040  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138426 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0682  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.868676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41340  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.383585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0034  tRNA-Arg  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0046  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0049  tRNA-Arg  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0007  tRNA-Arg  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.173702  normal  0.696884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0023  tRNA-Arg  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0029  tRNA-Arg  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0017  tRNA-Arg  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.915469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0025  tRNA-Arg  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0057  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0026  hypothetical protein  93.22 
 
 		 324 bp  77.8  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000553875  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  93.22 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000133182  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0039  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0477837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0033  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0029  tRNA-Arg  89.39 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0026  tRNA-Arg  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4570  tRNA-Arg  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0027  tRNA-Arg  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.005  hitchhiker  0.000281231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0017  tRNA-Arg  89.39 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0027  tRNA-Arg  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0275955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0040  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000798043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0018  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  0.24905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0040  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0061  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0042  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155325  normal  0.0810865 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0033  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.974847  normal  0.895856 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0241  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.628692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5013  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>