299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_R0023 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 76 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  96.92 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0025  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt24  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt24  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0070  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000571368  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0004  tRNA-Arg  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0041  tRNA-Arg  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0106412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0018  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0028  tRNA-Arg  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00106807  normal  0.150294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60210  tRNA-Arg  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0031  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  92.75 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0048  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00910953  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0046  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0022  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000177446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0033  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000397698  normal  0.298215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t025  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R55  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0040  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138426 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0018  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  0.24905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0033  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0022  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000850812  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0059  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413322 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0086  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0039  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000965131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0063  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0039  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247045  normal  0.262143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3506  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0019  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399679  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000104257  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0023  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0027  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000223271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0003  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00889349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t096  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000747728  normal  0.0921402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0113  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000284792  normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0047  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000357369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0028  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000331563  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0049  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000822334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t50  tRNA-Arg  90 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294768  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0787  tRNA-Arg  89.19 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.506305  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t45  tRNA-Arg  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA31  tRNA-Arg  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.977486  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0682  tRNA-Arg  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.868676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0086  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000450897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41340  tRNA-Arg  90 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.383585 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.04 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000427256  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0044  tRNA-Arg  94.34 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0102  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831784  decreased coverage  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0036  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.957158  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0009  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna45  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000100399  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000798043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0047  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0030  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54758  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0143  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000714151  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0088  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0020  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0817304 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0007  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.173702  normal  0.696884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0047  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000053333  hitchhiker  0.0000810038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0017  tRNA-Arg  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.915469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  91.04 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0041  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.707776  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06510  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000338303  normal  0.349036 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0048  tRNA-Leu  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0054    86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0039  tRNA-Arg  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0477837  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0064  tRNA-Arg  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294983  normal  0.0656653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>