245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0028 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0028  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000461136  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0006  tRNA-Asn  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.242548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0053  tRNA-Asn  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0046  tRNA-Arg  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000649566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  90.62 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0124116  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1999  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60210  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t50  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294768  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0040  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t45  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA31  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.977486  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R55  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0059  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413322 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0038  tRNA-Lys  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3506  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41340  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.383585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0039  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247045  normal  0.262143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0063  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0441285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0041  tRNA-Arg  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0106412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0057  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0021  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.489181  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399679  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000104257  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0113  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000284792  normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0057  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0047  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000357369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0029  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.179908  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309097  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0012  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.255284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0027  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.005  hitchhiker  0.000281231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4570  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0088  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.56142e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0028  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00528012  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309379  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0734599  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0007  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.688543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0033  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt24  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt24  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0008  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000700916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0001  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.285544  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0052  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0007  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.173702  normal  0.696884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0009  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0189312  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0033  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0088  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0033  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.974847  normal  0.895856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309170  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.269731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0490  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0026  hypothetical protein  88.24 
 
 		 324 bp  54  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000553875  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000133182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0818  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1961  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1960  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158848  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0030  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0479524  normal  0.8526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0043  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0076  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00038438  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0030  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000476466  normal  0.507447 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3045  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3046  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0395002  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2651  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00638973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2652  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122696  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2945  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0156149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0058  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3011  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.437147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2946  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0142864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0029  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00109449  normal  0.51543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1589  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00193926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1590  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000176536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3012  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0030  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0032  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121216  normal  0.785903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0031  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292671  normal  0.864836 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0029  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0009  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0136864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0081  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0141805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0028  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0029  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0030  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0026  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0057  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0056  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0027  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0248505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0028  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00884611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0029  tRNA-Arg  84 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00243187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>