82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_R0026 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00117786  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_830  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0067  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.74464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0031  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0048271  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  88.52 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0029  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0060  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000322774  normal  0.330331 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  86.89 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0017  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0454906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0016  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.889676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  88.52 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0718  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.953055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0031  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.745897  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0034  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0011  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tHis01  tRNA-His  88.68 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0013  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000258053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0055  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0855859  hitchhiker  0.00187773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0053  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.30391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  84.38 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0004  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0006  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0065  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0051  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0056  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0002  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0353519  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0001  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0045  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.249789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0001  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0043  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0685094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0041  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00651741  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19370  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0058  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0055  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.763699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0001  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0002  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0001  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0024  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0034  tRNA-Arg  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299722  normal  0.0234425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0043  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0005  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0002  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0038  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.495611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000571794  hitchhiker  0.0000531069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0052  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.108148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0046  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871205  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0026  hypothetical protein  100 
 
 		 324 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000553875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0019  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0771272  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0051  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000141075  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0010  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0833672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0039  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0477837  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00000133182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>