38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1417 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1417  tRNA-His  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  95.45 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  95.45 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  95.38 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  95.38 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0047  tRNA-His  93.85 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  96.49 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  96.49 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  96.49 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0085  tRNA-His  92.31 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317086  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  88.33 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0019  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.2337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1396  tRNA-His  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0040  tRNA-His  90.48 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0022  tRNA-His  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tHis01  tRNA-His  88.89 
 
 		 80 bp  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09670  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.253938  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0037  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0012  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0040  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0042  tRNA-His  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.187364  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309279  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0017  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.674136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0021  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0010  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0833672 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309368  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  88 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0017  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0013  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>