79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_R0033 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tHis01  tRNA-His  96.61 
 
 		 80 bp  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0023  tRNA-His  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794961  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0021  tRNA-His  94 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.730448  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0085  tRNA-His  90 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317086  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0047  tRNA-His  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0008  tRNA-His  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00267875  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-His-1  tRNA-His  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  90.38 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  90.38 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  90.38 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0011  tRNA-His  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0041  tRNA-His  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0011  tRNA-His  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1417  tRNA-His  88.33 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0078  tRNA-His  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0044  tRNA-His  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0022  tRNA-His  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.243573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0047  tRNA-His  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0623  tRNA-His  85.94 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104886  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00117786  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07709  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0523717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0013  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000258053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0048  tRNA-His  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0026  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_830  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4332  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00829837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0024  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt01  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0040  tRNA-His  90.7 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0024  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0014  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R10  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0027  tRNA-Asn  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0025  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0104  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013625  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0014  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0048  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0054  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0019  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.682883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.879602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1372  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0052  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0296253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0028  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00042704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0278993  normal  0.0571882 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0568  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.430637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0024  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00268867  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0431  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.147993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0114  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00121971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>