197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t1220 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  92.86 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  93.65 
 
 
77 bp  93.7  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  92.86 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  91.04 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1863  tRNA-Met  89.55 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000158589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  91.04 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0668  tRNA-Met  89.55 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  91.04 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  91.04 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  87.84 
 
 
80 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  87.84 
 
 
80 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-4  tRNA-Met  87.84 
 
 
80 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000411015  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5809  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0222  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000871168  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4993  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5024  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0084  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0133  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  87.67 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  90 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  90 
 
 
80 bp  71.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  90 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  90 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  90 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0119  tRNA-Met  88.89 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  89.83 
 
 
79 bp  69.9  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0115  tRNA-Met  88.89 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.791558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  89.83 
 
 
79 bp  69.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3898  tRNA-Met  89.55 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  90.16 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  90.16 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  90.16 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  90.16 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  90.16 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3515  tRNA-Met  89.06 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2777  tRNA-Met  89.06 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379753  normal  0.476878 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0964  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0491752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5708  tRNA-Met  87.3 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-8  tRNA-Met  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00195943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-7  tRNA-Met  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-1  tRNA-Met  87.3 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0139099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5791  tRNA-Met  87.3 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-5  tRNA-Met  87.3 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0844  tRNA-Met  87.3 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639074  normal  0.0213952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4296  tRNA-Met  87.3 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000610451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4409  tRNA-Met  87.3 
 
 
79 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00224529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0045  tRNA-Met  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0029  tRNA-Met  89.66 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0039  tRNA-Met  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067349  normal  0.10104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t30  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00107522  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0028  tRNA-Met  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0022  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1753  tRNA-OTHER  96.97 
 
 
61 bp  58  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0016922  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0007  tRNA-Met  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0016  tRNA-Met  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00509711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>