235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_t0033 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0084  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0222  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000871168  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  93.24 
 
 		 80 bp  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  93.24 
 
 		 80 bp  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.24 
 
 		 80 bp  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000411015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0133  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5024  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5809  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4993  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5708  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-8  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00195943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-7  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-1  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0139099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-5  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4409  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00224529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5791  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0844  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639074  normal  0.0213952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4296  tRNA-Met  90.54 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000610451 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0115  tRNA-Met  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.791558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0119  tRNA-Met  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0078  tRNA-Met  86.49 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376289  normal  0.616064 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt016  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0660  tRNA-Ile  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.834568  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0639  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000292173  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  89.36 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0124  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5015  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0225437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0291  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0167  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5743  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0188  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0115  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5663  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5647  tRNA-Asx  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5656  tRNA-Asx  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5705  tRNA-Asx  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5713  tRNA-Asx  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.423008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0717839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0074  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0033  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000091972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00125687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000687099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000965695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 153 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0042  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 153 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5053  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000166826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0078  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5650  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5800  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00845439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0231  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0269  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0042  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000134576  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0026  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000025046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0031  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000375909  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0078  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 153 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4984  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0027  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000161448  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0031  tRNA-Asn  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000435649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t67  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.812999  normal  0.19275 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>