121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_R0040 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_R0040  tRNA-His  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0209  tRNA-His  95.89 
 
 
75 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.524642  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-His-1  tRNA-His  89.04 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  93.62 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0476  tRNA-His  87.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000249939  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209319  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1417  tRNA-His  90.48 
 
 
78 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  96.67 
 
 
76 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607028  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0085  tRNA-His  91.11 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317086  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_002950  PGt18  tRNA-Gly  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0044  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.1121e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  89.58 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0011  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0022  tRNA-His  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0034  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  96.43 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  96.43 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  96.43 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0042  tRNA-His  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.187364  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0004  tRNA-Gly  96.43 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_003295  RS01506  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732279  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0018  tRNA-Gly  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.045305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3032  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0039  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000122131  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1602  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0710124  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0215661  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0020  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0183484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0799224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0030  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0191215  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2621  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0778487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0058  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0992  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2927  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2989  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.920581  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0155  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0062  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269971  normal  0.0642327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0050  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130847  hitchhiker  0.00000000426742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0055  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.1453 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0040  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0418849 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0547169  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0040  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0920487  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0022  tRNA-Phe  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0613646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0072  tRNA-Met  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.916606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13850  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13870  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0328341  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0014  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PGt08  tRNA-Trp  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  89.13 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt017  tRNA-Phe  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00428757  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2519  tRNA-His  86 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00159808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2530  tRNA-His  86 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2223  tRNA-His  86 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000628537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2234  tRNA-His  86 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07725  tRNA-Gly  93.33 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0053  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  89.13 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  89.13 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1676  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000911888  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  89.13 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2194  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000558715  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000227185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0021  tRNA-His  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0207  tRNA-Phe  100 
 
 
78 bp  44.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  89.13 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>