93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0431 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0431  tRNA-Ala  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.147993  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0005  tRNA-Ala  90.54 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000213903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0010  tRNA-Ala  90.54 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0005  tRNA-Ala  90.54 
 
 
73 bp  83.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0005  tRNA-Ala  90.54 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000781338  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0003  tRNA-Ala  90.54 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00134196  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0045  tRNA-Ala  89.83 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000176076  normal  0.226339 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0014  tRNA-Gly  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0003  tRNA-Ala  87.84 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.774544  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0041  tRNA-Ala  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0260276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0037  tRNA-Ala  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.021593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0010  tRNA-Ala  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.870532  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1674  tRNA-Gly  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000649019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.263748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0052  tRNA-Ala  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.495975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0036  tRNA-Ala  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  0.0000641182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0016  tRNA-Ala  86.89 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.367308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_002950  PGt05  tRNA-Ala  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000322453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0027  tRNA-Gly  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257176  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PGt36  tRNA-Ala  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244061 
 
 
-
 
NC_002950  PGt30  tRNA-Ala  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0034  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299722  normal  0.0234425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  87.1 
 
 
76 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  87.1 
 
 
76 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0051  tRNA-Arg  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0020  tRNA-Ala  92.11 
 
 
75 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.536961  normal  0.2576 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0015  tRNA-Ala  87.72 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000110801  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0049  tRNA-Ala  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00105958  hitchhiker  0.000875041 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0031  tRNA-Ala  87.72 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0202697  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0026  tRNA-Ala  87.72 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0046  tRNA-Gly  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0761072  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  87.72 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0021  tRNA-Gly  88.64 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00100  tRNA-Ala  90 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  88.64 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  86.54 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0021  tRNA-Gly  88.64 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000904393  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt45  tRNA-Ala  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0027  tRNA-Ala  84.75 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.554328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0040  tRNA-Val  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000943403  normal  0.0843805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0029  tRNA-Arg  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323491  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0011  tRNA-Val  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAla02  tRNA-Ala  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0042  tRNA-Val  90.7 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  85.71 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0032  tRNA-Ala  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.168105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0051  tRNA-Ala  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0002  tRNA-Ala  86.21 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1352  tRNA-Ala  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00031485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07685  tRNA-Ala  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954113  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  85.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309290  tRNA-Ala  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  84.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0034  tRNA-Ala  83.78 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000564918  normal  0.218531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  84.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0021  tRNA-Ala  83.78 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000106448  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  84.48 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0039  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287509  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14002  tRNA-Ala  86.21 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0033  tRNA-Val  85.48 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.929932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0045  tRNA-Ala  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.760301  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0041  tRNA-Val  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>