299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_R0027 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0028  tRNA-His  94.92 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.252923  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0049  tRNA-His  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000343908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0044  tRNA-His  94.92 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000342103  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0041  tRNA-His  94.92 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0113138  normal  0.890079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0011  tRNA-His  94.92 
 
 
76 bp  93.7  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136335  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  94.92 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  90.91 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  90.91 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0045  tRNA-His  93.22 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000161818  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t38  tRNA-His  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100556  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2136  tRNA-His  89.04 
 
 
79 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00922633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  90.77 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2211  tRNA-His  89.04 
 
 
79 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1684  tRNA-His  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.592978  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1469  tRNA-His  90.48 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0082  tRNA-His  89.39 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0036  tRNA-His  91.38 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000713799  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-His-1  tRNA-His  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2041  tRNA-His  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000147998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0047  tRNA-His  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1762  tRNA-His  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0042  tRNA-His  91.53 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.187364  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  88.06 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0016  tRNA-His  90.74 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0319079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-His-1  tRNA-His  90.57 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14029  tRNA-His  87.67 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205987 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_831  tRNA-His  90.57 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000011255  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0023  tRNA-His  87.01 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0027  tRNA-His  90.57 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0022  tRNA-His  89.06 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0085  tRNA-His  88.33 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317086  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0047  tRNA-His  93.02 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.030582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0033  tRNA-His  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184442  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0040  tRNA-His  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.651238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4336  tRNA-His  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0070  tRNA-His  86.49 
 
 
78 bp  60  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0203804  normal  0.914236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0021  tRNA-His  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.730448  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0063  tRNA-His  88.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0004  tRNA-His  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.817868  normal  0.0325973 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0069  tRNA-His  88.71 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0021  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0029  tRNA-His  88.52 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.499357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0053  tRNA-His  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629076  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06590  tRNA-His  86.15 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.435394 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0045  tRNA-His  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447472  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28660  tRNA-His  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0457487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0028  tRNA-His  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392784  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  85.29 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0033  tRNA-His  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0036  tRNA-His  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0128871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0033  tRNA-His  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.704433  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0037  tRNA-His  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0609753  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0032  tRNA-His  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  84.51 
 
 
77 bp  54  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0005  tRNA-His  90.7 
 
 
73 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0002  tRNA-His  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0014  tRNA-His  90 
 
 
76 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2519  tRNA-His  87.1 
 
 
76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00159808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2530  tRNA-His  87.1 
 
 
76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2223  tRNA-His  87.1 
 
 
76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000628537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2234  tRNA-His  87.1 
 
 
76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0037  tRNA-His  84.85 
 
 
74 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.740745  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3505  tRNA-His  84.42 
 
 
78 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1556  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS02876  tRNA-His  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313769  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1751  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000295955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1533  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.102488  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lppt23  tRNA-His  86.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt23  tRNA-His  86.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0031  tRNA-His  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0040  tRNA-His  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.262855 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1920  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0104306  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09720  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000962233  hitchhiker  0.0000117108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0047  tRNA-His  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.627276  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3503  tRNA-His  84.42 
 
 
78 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0023  tRNA-His  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0038  tRNA-His  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000137357  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0038  tRNA-His  84.06 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00502124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1519  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000581354  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0045  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000395206  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0016  tRNA-His  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0024  tRNA-His  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0011  tRNA-His  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5036  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4668  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314949  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0040  tRNA-His  89.58 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1417  tRNA-His  88.46 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0052  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0057  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0006  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4229  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000067821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>