48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06590 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06590  tRNA-His  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.435394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0016  tRNA-His  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  95.71 
 
 
77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0082  tRNA-His  90.91 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305827  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0049  tRNA-His  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000343908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0051  tRNA-His  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000083549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0044  tRNA-Pro  90 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.123101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0033  tRNA-His  87.88 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184442  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0055  tRNA-Pro  88.33 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  90.2 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0036  tRNA-His  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000713799  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-His-1  tRNA-His  88.89 
 
 
72 bp  60  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  86.15 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13120  tRNA-His  92.31 
 
 
77 bp  54  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.100259  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0070  tRNA-His  92.11 
 
 
78 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0203804  normal  0.914236 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1326  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0022  tRNA-His  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_831  tRNA-His  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000011255  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0027  tRNA-His  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-His-1  tRNA-His  92.11 
 
 
76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0024  tRNA-His  85.71 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.77166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0037  tRNA-His  100 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000665099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0052  tRNA-His  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0296253  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0041  tRNA-His  91.43 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  86.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  86.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tHis01  tRNA-His  93.55 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000397081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-His-1  tRNA-His  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505753  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000151787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0033  tRNA-His  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000111459  hitchhiker  0.00510408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2519  tRNA-His  92.11 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00159808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2530  tRNA-His  92.11 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2223  tRNA-His  92.11 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000628537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2234  tRNA-His  92.11 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0039  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000281938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0335757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0075  tRNA-Ala  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000858856  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0040  tRNA-Ala  100 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000050813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>