More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4668 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4668  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2379  tRNA-Val  98.73 
 
 
79 bp  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000292558  hitchhiker  0.00911124 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2149  tRNA-Val  98.73 
 
 
79 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000169486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1531  tRNA-Val  98.73 
 
 
79 bp  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000929457  hitchhiker  0.00112826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00028  tRNA-Val  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.813226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0047  tRNA-Val  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0063  tRNA-Val  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000215806  hitchhiker  0.00000333382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0062  tRNA-Val  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000022739  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0045  tRNA-Val  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0053  tRNA-Val  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452595  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0061  tRNA-Val  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000225678  hitchhiker  0.00000327406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1202  tRNA-Val  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0491839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5036  tRNA-Val  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000151572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2580  tRNA-Val  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0938444  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4230  tRNA-Val  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000689927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4229  tRNA-Val  96.15 
 
 
79 bp  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000067821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0076  tRNA-Val  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00448767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0052  tRNA-Val  97.26 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0075  tRNA-Val  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00433017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0041  tRNA-Val  97.26 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0054  tRNA-Val  98.46 
 
 
77 bp  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0571511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0046  tRNA-Val  98.46 
 
 
77 bp  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1533  tRNA-Val  93.59 
 
 
79 bp  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.102488  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1751  tRNA-Val  93.59 
 
 
79 bp  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000295955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1519  tRNA-Val  93.59 
 
 
79 bp  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000581354  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1201  tRNA-Val  95.71 
 
 
77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0742483  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1920  tRNA-Val  93.59 
 
 
79 bp  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0104306  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2581  tRNA-Val  93.59 
 
 
79 bp  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0567199  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1556  tRNA-Val  93.59 
 
 
79 bp  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0031  tRNA-Val  96.92 
 
 
77 bp  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00270422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0070  tRNA-Val  96.92 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000820033  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0069  tRNA-Val  96.92 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229538  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0029  tRNA-Val  96.83 
 
 
77 bp  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0054  tRNA-Val  94.29 
 
 
77 bp  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322484  hitchhiker  0.000000167745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t069  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00122297  hitchhiker  0.00465561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t039  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t040  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0064  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00446845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0063  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00384271  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0061  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0062  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.202264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna124  tRNA-Val  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0073  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00216703  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0089  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000402356  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0090  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000384332  normal  0.221127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0100  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395733  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0101  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.003873  normal  0.249554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t068  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0011202  hitchhiker  0.00473676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0062  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0074  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00199895  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0042  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00634518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0043  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131984  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0085  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0569302  hitchhiker  0.00000332622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0086  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.236197  normal  0.0136376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0087  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.235286  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0067  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.325907  normal  0.0460929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0061  tRNA-Val  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  98.18 
 
 
77 bp  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t34  tRNA-Val  98.18 
 
 
77 bp  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0987104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t35  tRNA-Val  98.18 
 
 
77 bp  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0521138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA41  tRNA-Val  98.18 
 
 
77 bp  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA42  tRNA-Val  98.18 
 
 
77 bp  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191671  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R39  tRNA-Val  98.18 
 
 
77 bp  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0141809  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0045  tRNA-Val  98.18 
 
 
77 bp  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.431879  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00027  tRNA-Val  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.825713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0048  tRNA-Val  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000092114  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1520  tRNA-Val  92.86 
 
 
79 bp  99.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00188804  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1888  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1133  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0012  tRNA-Val  98.15 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000181787  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2378  tRNA-Val  92.86 
 
 
79 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000316536  hitchhiker  0.00924941 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0339  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0351781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2457  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1534  tRNA-Val  92.86 
 
 
79 bp  99.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0495924  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0006  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2148  tRNA-Val  92.86 
 
 
79 bp  99.6  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000010936  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1750  tRNA-Val  92.86 
 
 
79 bp  99.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307379  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0001  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0026  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000276019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0004  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0212233  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0004  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0580435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0001  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0203  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00945827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28190  tRNA-Val  98.15 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.018303  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0004  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105423  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0039  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00187665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1710  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5035  tRNA-Val  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000158599  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0077  tRNA-Val  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00426255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4228  tRNA-Val  92.86 
 
 
79 bp  99.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1532  tRNA-Val  92.86 
 
 
79 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000254029  hitchhiker  0.00110314 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1919  tRNA-Val  92.86 
 
 
79 bp  99.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0105703  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0041  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075941  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0961  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0032972  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2749  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1734  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2904  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1541  tRNA-Val  98.15 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.713195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4667  tRNA-Val  92.86 
 
 
79 bp  99.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>