299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0038 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0038  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00502124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0041  tRNA-His  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0294  tRNA-His  97.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0037  tRNA-His  90.77 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.740745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0006  tRNA-His  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4558  tRNA-His  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0006  tRNA-His  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104917  hitchhiker  0.000204838 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13674  tRNA-His  92.73 
 
 		 70 bp  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0006  tRNA-His  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.828778  normal  0.262269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0023  tRNA-His  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794961  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0021  tRNA-His  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.730448  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0044  tRNA-His  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000342103  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0028  tRNA-His  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.252923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0011  tRNA-His  89.06 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0041  tRNA-His  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0113138  normal  0.890079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0015  tRNA-Asp  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0036  tRNA-Asp  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000395682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA43  tRNA-Asp  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0034  tRNA-Asp  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0031  tRNA-Asp  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0046  tRNA-Asp  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0031  tRNA-Asp  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t38  tRNA-His  87.5 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0045  tRNA-His  87.5 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000161818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0048  tRNA-His  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0004  tRNA-His  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0477942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0047  tRNA-His  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0044  tRNA-His  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0039  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299876 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0777  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0008  tRNA-His  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00267875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0056  tRNA-Asp  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0848  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.473747  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0021  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0040  tRNA-Asp  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0022  tRNA-His  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.243573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t29  tRNA-His  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.158046  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1548  tRNA-His  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0065  tRNA-His  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0031  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000203604  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  85.71 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0011  tRNA-His  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0019  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000618512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0033  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000000933276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t12  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0503237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt02  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00626728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0014  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0046  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0033  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0034  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0045  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0013  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4562  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0038  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0015  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.103897  normal  0.235833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0013  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0021  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0795  tRNA-Asp  85.48 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0019  tRNA-His  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0628666  normal  0.210857 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-His-1  tRNA-His  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0045  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804977  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0037  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0096  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0036    84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132649  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0020  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.539056  normal  0.0659603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0027  tRNA-His  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000752575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0049  tRNA-His  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000343908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0048  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0049  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0038  tRNA-His  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0093  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0094  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0035  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0062  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.648574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0006  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0052  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.461525 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0054  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0035  tRNA-His  85.94 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000105809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0019  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0058  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.647177  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0064  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17499  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0011  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0025  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0599  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>