More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_R0015 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0036  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000395682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0015  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0777  tRNA-Asp  94.67 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  94.67 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0021  tRNA-Asp  94.67 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  94.67 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0039  tRNA-Asp  94.67 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0040  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4562  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0014  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt02  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00626728  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0033  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0034  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0194372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0013  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729224  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0015  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.103897  normal  0.235833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0021  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0795  tRNA-Asp  93.33 
 
 
79 bp  109  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0013  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0045  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0046  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t12  tRNA-Asp  94.2 
 
 
74 bp  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0503237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0031  tRNA-Asp  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4563  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0056  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0034  tRNA-Asp  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0031  tRNA-Asp  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0046  tRNA-Asp  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0014  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.55678  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA43  tRNA-Asp  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353058 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0298  tRNA-Asp  92 
 
 
79 bp  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00212865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0014  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0015  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0043  tRNA-Asp  92.31 
 
 
78 bp  99.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0033  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000000933276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0031  tRNA-Asp  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000203604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  91.67 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0006  tRNA-Asp  94.83 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000433123  normal  0.0757617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0048  tRNA-Asp  93.44 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0020  tRNA-Asp  93.44 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.539056  normal  0.0659603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0049  tRNA-Asp  93.44 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0045  tRNA-Asp  93.44 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804977  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0035  tRNA-Asp  93.44 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0037  tRNA-Asp  93.44 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0045  tRNA-Ser  97.92 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0044  tRNA-Asp  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0027  tRNA-Asp  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245958  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0028  tRNA-Asp  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607883  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0848  tRNA-Asp  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.473747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0029  tRNA-Asp  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139621  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0030  tRNA-Asp  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0028  tRNA-Asp  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  91.8 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  92.19 
 
 
78 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0020  tRNA-OTHER  95.83 
 
 
72 bp  79.8  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4317  tRNA-Asp  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.771522  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0014  tRNA-Asp  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.791335  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0015  tRNA-Asp  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0016  tRNA-Asp  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.816839  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6033  tRNA-Asp  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.908357  normal  0.208238 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0018  tRNA-Asp  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0034  tRNA-Asp  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0035  tRNA-Asp  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6034  tRNA-Asp  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.93695  normal  0.213156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0026  tRNA-Asp  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522695  normal  0.33035 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  94 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000248488  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0019  tRNA-Asp  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0753679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0016  tRNA-Asp  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.034253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2942  tRNA-Asp  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2945  tRNA-Asp  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.393325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2948  tRNA-Asp  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282487  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2625  tRNA-Asp  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2628  tRNA-Asp  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2631  tRNA-Asp  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.830892  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0002  tRNA-Asp  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0006  tRNA-Asp  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  90.16 
 
 
79 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0038  tRNA-Asp  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298827  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0017  tRNA-Asp  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0019  tRNA-Asp  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.206388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0044  tRNA-Asp  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  92.31 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  90.62 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  92.31 
 
 
78 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  92.31 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4316  tRNA-Asp  88.89 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0025  tRNA-Asp  88.89 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103227  normal  0.238575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>