138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-His-1 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-His-1  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0031  tRNA-His  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.679826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0041  tRNA-His  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0023  tRNA-His  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0030  tRNA-His  92.06 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0623  tRNA-His  91.8 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104886  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tHis01  tRNA-His  89.66 
 
 		 80 bp  67.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0048  tRNA-His  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0022  tRNA-His  88.57 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.243573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0033  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0085  tRNA-His  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317086  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0021  tRNA-His  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.730448  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0037  tRNA-His  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.740745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0052  tRNA-His  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0296253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0612672  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0021  tRNA-His  90.38 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0004  tRNA-His  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0477942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0021  tRNA-His  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0582206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t29  tRNA-His  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.158046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0048  tRNA-Asp  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0034  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0031  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0046  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0023  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.506131  normal  0.313927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA43  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353058 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1548  tRNA-His  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0039  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299876 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0065  tRNA-His  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6018  tRNA-His  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0522895  normal  0.0385855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0011  tRNA-His  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0038  tRNA-His  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00502124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0031  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0021  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0045  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00121636  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0095  tRNA-His  85.29 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0119  tRNA-His  85.29 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0557096  normal  0.380201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0037  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0017  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.547674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0001  tRNA-Met  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0049  tRNA-Asp  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0033  tRNA-His  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0035  tRNA-Asp  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  83.58 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  83.58 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  83.58 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09670  tRNA-His  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.253938  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0044  tRNA-His  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0037  tRNA-Asp  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0020  tRNA-Asp  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.539056  normal  0.0659603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0045  tRNA-Asp  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.804977  normal  0.403713 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R18  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00014  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000132366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0061  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.9923400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0065  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t35  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0521138  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt022  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000116471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA41  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA42  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191671  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000440965  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000386072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0067  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000631396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0068  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000545577  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0091  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.62007  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0035  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000330461  hitchhiker  0.000751114 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1771  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000741128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2457  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0010  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4650  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000849948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4654  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.94372e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5015  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000219916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5019  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000540299  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0579  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000127758  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0054  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000015644  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0056  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0734  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0738  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000396563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0793  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00146175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0798  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00121297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0828  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000835761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0720  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147537  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0724  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000898131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0781  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000729773  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0785  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000059431  normal  0.369596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>